对于输精管梗阻的治疗，主要以手术治疗，包括输精管道吻合术、输精管附睾吻合术、经尿道射精管切开术。射精管梗阻要经尿道射精管切开术治疗。附睾端输精管梗阻可以做输精管附睾吻合术。
    对于输精管其它部位的梗阻应做输精管吻合术，引起输精管堵塞原因不同，吻合术的成功率也有很大差别，根据输精管堵塞的原因有炎症引起的不通，还有做医源性引起的输精管不通，如做腹股沟疝气手术或隐睾手术误伤输精管引起的不通，还有男扎后要求复通者。若是结核或者严重的炎症做成的输精管阶段性堵塞较长，或者全程梗阻，则不适宜做输精管吻合，具体应根据输精管造影检查的结果确定是否需要做此手术。男扎复通术的成功率比外伤因素引起的输精管不通复通率高。
    输精管复通率与吻合方法直接相关，输精管吻合术分为传统普通外科输精管吻合法和显微外科输精管吻合法两种，后者的复通率远远高于前者。常规吻合方法简单，易于掌握，适于各级医疗机构开展，但手术成功率较低。Oconnor曾调查，传统方法成功率为38%。显微吻合可使输精管各层对合整齐，手术成功率明显高于常规输精管吻合法。总体成功率在90%以上。术后妊娠率高，术后的妊娠率除与手术密切相关外，还与结扎的年限，年龄有有关。年龄在40岁以下，结扎7年内做显微复通的成功率和妊娠率高。若年龄超过40岁，结扎超过10年则手术后妊娠率明显降低。所以一旦确定做输精管吻合，应尽早手术治疗效果好。
    显微外科输精管全层吻合术与传统手术、普遍的显微外科输精管端端吻合术和人工授精技术相比较存在以下优势：
    1、避免了传统普外吻合术不能做到准确对合，输精管粘膜对位不良或有组织嵌入，存在着管腔狭窄或慢性梗阻，近睾端输精管内压增高，导致的手术失败。
    2、显微外科定位输精管吻合技术因在吻合前根据吻合管径的大小精确定位了缝线位置，因此在吻合时可以不用考虑缝合线位置而集中精力进行吻合操作，所以，即使在吻合两端管腔直径明显不匹配的情况下也能获得良好的吻合效果。
    3、采用全层吻合术缝合，不易勒破输精管粘膜，线结不留在吻合口肌层间，全层缝合完全对合严密，且愈合良好。该方法缩短了手术时间，减少了手术并发症，术后狭窄概率小，复通率高。
    4、与IVF（体外受精联合胚胎移植技术）和ICSI(卵浆内单精子注射)技术相比，具有自然受孕，减小多胎风险；成本低；对女性生理无干扰等优点。
输精管-输精管吻合术的手术适应症有如下几个方面：
    1）输精管结扎术后，子女死亡要求再育者。
    2）输精管结扎术后，配偶死亡或离异而再婚者。
    3）输精管结扎术后，并发非手术疗法不能治愈的附睾郁积症者。
    4）输精管结扎后，由于精神因素而发生性功能障碍，经用各种疗法不能收效，需用输精管吻合术作为精神疗法者。
    5）外伤或手术时意外输精管损伤者。
    6）因生殖系统炎症感染而致输精管阻塞者。